文書情報設定時、入力ファイルにMetadataが存在しない場合、Metadataが新たに作成されます。
PDF Tool APIでは、保存処理時に文書情報の「更新日時」を設定しますので、コマンドライン利用時では保存を行うと自動的にMetadataが作られることになります。