『PDF Advanced Extractor』の操作画面では、キーボードから以下のショートカットキーが使用できます。
| Delete | 選択したオブジェクトを削除する |
| Esc | 選択／コマンドを解除する |
| Ctrl + A | すべて選択する |
| Ctrl + S | 名前をつけて保存、または上書き保存する |
| Ctrl + Z | 操作を元に戻す |
| Alt + BackSpace | 操作を元に戻す |
| Ctrl + Y | 操作をやり直す |
| Shift + Alt + BackSpace | 操作をやり直す |
| Ctrl + X | 選択した項目を（クリップボードに）切り取る |
| Shift + Delete | 選択した項目を（クリップボードに）切り取る |
| Ctrl + C | 選択した項目を（クリップボードに）コピーする |
| Ctrl + Insert | 選択した項目を（クリップボードに）コピーする |
| Ctrl + V | （クリップボードの内容を）貼り付ける |
| Shift + Insert | （クリップボードの内容を）貼り付ける |
| PageUp | 前のページを表示する |
| PageDown | 次のページを表示する |
| Ctrl + ← | 前のページを表示する |
| Ctrl + → | 次のページを表示する |
| Ctrl + PageUp | 先頭ページを表示する |
| Ctrl + PageDown | 最終ページを表示する |
| Shift + A | 「選択」ツールに切り替える |
| Shift + X | 「ズーム」ツールに切り替える |
| Shift + Z | 「手のひら」ツールに切り替える |
| Tab | 次のオブジェクトを選択する |
| Shift + Tab | 前のオブジェクトを選択する |
| →／↑／↓／← | 選択したオブジェクトを上下左右に移動する |
| F1 | オンラインヘルプを表示する |
| Alt | キーボードでリボンを操作するモードにする。現在のビューで使用可能なキーは各機能の上にキーヒントとして表示する |
| Space | 選択しているオブジェクト以外の枠を非表示にする |