PDF Serverにおいて、オフィス/アプリケーション変換を行う場合はログオンした状態でないと実行する事はできません。サーバーOSではデフォルトで自動ログオンする事ができないため、日常の運用の中で再起動を自動で行うケース（Windows Updateなども含みます）が存在する場合には自動ログオンとPDF Serverの自動起動の設定を行う必要があります。なお、「オフィス変換（Office使用）」／「アプリケーション変換」機能を用いてPDF変換を行う場合には、PDFコンバーターの自動起動も必要ですが、こちらについては「PDFコンバーターについて」の項を参照して下さい。